在常用的磁选设备中，在分选的同时不可避免地产生磁团聚现象，造成了脉石和贫连生体在精矿中的夹杂，降低了精矿质量。而在磁聚机中恰恰利用了这种磁团聚现象，在磁聚机中设置了一个磁场强度分布比较均匀的弱磁场，磁性颗粒在其中受到这外加弱磁场的作用，得到进一步磁化，特别是高品位的细粒级磁铁矿颗粒将被粗颗粒磁铁矿颗粒所吸附和絮团在随矿浆流动时，在到达零磁场区和受到矿奖剪切力的作用，将变得松散甚至解体，当进入另一个小磁场区后又将变得紧密或组成新的团聚颗粒或絮团。　　

　磁聚机的分选原理符合“不同密度粒群垂向分层”学说。圆柱部分符合“不同密度粒群在上升水介质中按悬浮体相对密度分层”学说；圆锥部分则由其过渡为“不同密度粒群在上升介质流中按重介质作用分层”学说。矿浆给入磁聚机内，磁性矿物形成团聚与非磁性矿物及连生体在矿浆中沉降速度差异较大，矿浆由上向下沉降，而随着轴向磁场强度的变化，加之由上升水的剪切作用，矿浆在整个分选过程中，经过多次团聚—分散—团聚，夹杂在磁团聚中的脉石及连生体经过多次分选，而比重较大的磁性矿粒形成矿床，克服上升水的作用，不断下沉到槽底，成为作业精矿矿浆由给矿箱的分矿管切向给入分选筒，给水系统给入分选区的补加水旋转上升，矿物在重力、上升水等作用而进行分选；锥体部分断面积迅速减小使物料浓缩，排剂连生体向上运动。